Čištění vířivky se dá rozdělit na tři části. Čištění skořápky vířivky, čištění trysek a potrubí vířivky, čištění kabinetu a termokrytu vířivky. Je velmi užitečné před každým novým napouštěním vířivky vodou věnovat pozornost čištění skořápky vířivky, trysek a potrubí vířivky.